已有“OrthoFinder/Results_Jul11/Orthogroups ”
发简信
IP属地：黑龙江
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开放问题：如何从OrthoFinder2的Single_Copy_Orthologue_Sequences蛋白序列集提取CDS进行正选择分析
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学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
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服务器(centos)R语言安装Stringi报错 在R中直接安装 install.packages("string") 出现无法联网报错，截图忘记截了，大概就是一个github的网站无法连上，导致后面的安装出错，其实主...
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宏基因组分析3-数据质量控制(trimmomatic)
trimmomatic安装 trimmomatic是用JAVA编写的程序，将软件下载解压后就可直接使用 trimmomatic使用 trimmomatic的用法可以参考官方手...
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ipyrad分析RAD数据（官网给出）的详细操作步骤（入门级）序言：目前（截止2020.04.01），针对RAD-seq数据的分析软件主要有伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校Catchen实验室的STACKS和哥伦比亚大学Deren Eato...
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使用Maxent最大熵模型模拟物种适生区操作步骤1.所需软件： Maxent生态位模型软件 (此软件是用Java语言编写的，需Java运行环境，请先去Java官网(http://java.com[https://link....
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ArcGIS中栅格数据重采样方法2.用ArcGIS中的Resampling工具进行栅格重采样操作 在ArcToolbox中依次找到Data Management Tools—>Raster—>Raster ...
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2019-12-08 Day7 基因测序原理测序过程和原理 第一代测序 Sanger测序原理由于ddNTP的2’和3’都不含羟基，其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键，因此可以用来中断DNA合成反应。在4个DNA合...
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简化基因组的测序方法RAD-Seq(restriction site-associated DNA sequencing)最开始指的是2008年发表在PLOS ONE上“Rapid SNP di...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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使用stack分析RAD-seq一次简化基因组数据分析实战 尽管目前已经有大量物种基因组释放出来，但还是存在许多物种是没有参考基因组。使用基于酶切的二代测序技术，如RAD-seq，GBS，构建遗传图谱是研究...
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质量检测：FastQC拿到测序数据后我们首先要进行质量评估（Quality Control），常用的工具就是FastQC。FastQC的详细使用说明：http://www.bioinformati...
