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    【Rna-seq 分析流程】12. 药物预测与分子对接

    1. 简介 预测与AAV相关的潜在药物,并探究AAV发病过程中的关键基因与潜在药物之间的相互关系。 2. 数据信息 关键基因基因名 3. 思路 ...

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    【Rna-seq 分析流程】11. GeneMANIA和分子调控网络

    1. 简介 推测关键基因的作用和调控机制, 可以通过关键基因与其功能相似基因之间的相互作用和功能,进行类比; 通过研究关键基因mRNA,miRN...

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    【Rna-seq 分析流程】10. RNA甲基化修饰

    1. 简介 研究RNA甲基化修饰与AAV之间的内在联系,有助于揭示AAV的发病机制,为开发新的诊断标志物和治疗靶点提供理论依据,从而为精准治疗开...

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    【Rna-seq 分析流程】09. 免疫浸润分析

    1. 简介 AAV与免疫细胞关系密切,在该疾病发生时,各类免疫细胞会被异常激活,探究AAV发生发展过程中免疫细胞的变化情况及其它们之间的相互关系...

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    【Rna-seq 分析流程】08. GSEA分析

    1. 简介 GSEA分析可以揭露关键基因在AAV发展过程中参与的相关信号通路,以了解关键基因在生物过程中的作用。 2. 数据信息 org.Hs....

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    【Rna-seq 分析流程】07.关键基因定位和相关性分析

    1. 简介 了解关键基因所在区域的染色质结构和表观遗传特征对关键基因表达的影响。 2. 数据信息 人类基因注释: UCSC.HG19.Human...

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    【Rna-seq 分析流程】06. 列线图的构建

    1. 简介 列线图(Alignment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图)根据多因素回归分析的结果,将多个预测指标整合并可视化到...

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    【Rna-seq 分析流程】05. Wilcoxon秩和检验比较

    1. 简介 为了观察特征基因在训练集和验证集中是否具有一致的表达趋势,在训练集和验证集所有样本中,通过 Wilcoxon秩和检验比较AAV组样本...

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    【Rna-seq 分析流程】04 机器学习-构建风险模型

    1. 简介 基于转录组训练集中所有样本,构建风险模型,筛选基因机器学习方法: LASSO 逻辑回归算法构建模型筛选候选基因 SVM-RFE 向量...