1. 简介 预测与AAV相关的潜在药物,并探究AAV发病过程中的关键基因与潜在药物之间的相互关系。 2. 数据信息 关键基因基因名 3. 思路 [DGIdb数据库](http...

1. 简介 预测与AAV相关的潜在药物,并探究AAV发病过程中的关键基因与潜在药物之间的相互关系。 2. 数据信息 关键基因基因名 3. 思路 [DGIdb数据库](http...
1. 简介 推测关键基因的作用和调控机制, 可以通过关键基因与其功能相似基因之间的相互作用和功能,进行类比; 通过研究关键基因mRNA,miRNA和 lncRNA之间的关系获...
1. 简介 研究RNA甲基化修饰与AAV之间的内在联系,有助于揭示AAV的发病机制,为开发新的诊断标志物和治疗靶点提供理论依据,从而为精准治疗开辟新路径。 2. 数据信息 关...
1. 简介 AAV与免疫细胞关系密切,在该疾病发生时,各类免疫细胞会被异常激活,探究AAV发生发展过程中免疫细胞的变化情况及其它们之间的相互关系具有重要意义。 2. 数据信息...
1. 简介 GSEA分析可以揭露关键基因在AAV发展过程中参与的相关信号通路,以了解关键基因在生物过程中的作用。 2. 数据信息 org.Hs.eg.db 关键基因"VCAN...
1. 简介 了解关键基因所在区域的染色质结构和表观遗传特征对关键基因表达的影响。 2. 数据信息 人类基因注释: UCSC.HG19.Human.CytoBandIdeogr...
1. 简介 列线图(Alignment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图)根据多因素回归分析的结果,将多个预测指标整合并可视化到同一图片上来展示预测模型中各个...
1. 简介 为了观察特征基因在训练集和验证集中是否具有一致的表达趋势,在训练集和验证集所有样本中,通过 Wilcoxon秩和检验比较AAV组样本和对照组样本中特征基因的表达水...
1. 简介 基于转录组训练集中所有样本,构建风险模型,筛选基因机器学习方法: LASSO 逻辑回归算法构建模型筛选候选基因 SVM-RFE 向量机-递归特征消除算法筛选候选基...
1. 简介 网址:Metascape[https://metascape.org/gp/index.html?crawl=maunal_meta#/main/step1]Me...
1. 简介 网址:STRING: functional protein association networks[https://cn.string-db.org/] PPI...
原创来自https://mp.weixin.qq.com/s/xw-x_r9yq6Iiw-4LwyKvWw,本人稍作修改,原文是针对小鼠,现改为人类当得到差异基因后,很多时候...
1. 简介 一般在获得差异基因后,可以通过 GO 或者 KEGG 对这些基因进行富集分析,其目的是找到这些基因之间的内在关系。有关联的基因可能存在与同一通路的上下游,或存在与...
1. 简介 上一步获取到差异基因共得到246个差异基因,相比对照组,上调77个基因,下调169个基因。这些差异基因有些多,后续想要进一步针对性研究,有很多方法可以筛选。这里是...
1. 简介 差异分析是两组数据集间的比较,可以分为对照组样本(Control),和目标组样本(可以是处理样本 - Treat,或疾病样本 - Illness)。这里研究的是患...
本系列文章是简单的 Rna-seq 分析全流程,主要是代码和结果展示。 1. 简介 分析数据可以从 NCBI,GEO 等网站上下载,进行数据挖掘,本次使用数据从 GEO 下载...
这篇文主要参考 Tn5 as a model for understanding DNA transposition,来了解Tn5的转座机制。转座概念参与分子转座过程 转座 ...
「简书」作为一款「写作软件」在诞生之初就支持了 Markdown,Markdown 是一种「电子邮件」风格的「标记语言」,我们强烈推荐所有写作者学习和掌握该语言。为什么?可以...