R包安装遇到的问题: 在安装R包时,通常会采用:install.packages("xxx") 进行安装,有时会碰到如下错误信息: package 'xx...
R包安装遇到的问题: 在安装R包时,通常会采用:install.packages("xxx") 进行安装,有时会碰到如下错误信息: package 'xx...
有时图例较多,用ggplot2画图时候会出现图例占据图的半壁江山,想让图例排成一列,解决方法如下: guides(fill = guide_legend( ncol = 1,...
操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTU)是在系统发生学研究或群体遗传学研究中,为便于分析,人为给某一个分类单元(品系,种,属,分组等)设...
以下内容参考出处(侵删):https://zhuanlan.zhihu.com/p/57756620 差异研究的目的在于比较两组数据或多组数据之间的差异,通常包括以下几类分析...
箱盒图共由五个数值点构成,分别是最小观察值(下边缘),25%分位数(Q1),中位数,75%分位数(Q3),最大观察值(上边缘)。 中横线:中位数 IQR:75%分位数(Q3)...
人类基因组中存在大量的重复区域,给定一段序列,如何知道这段序列在基因组中是否具有唯一比对,或者具有多个比对? 一种方法是通过bwa,通过AS和XS 标签判断是否有次优比对;但...
1. 字符串替换 sed-i s#/share/path1#/share/other#gfilename 2. 取出文件某几行的内容 sed -n '12,15p' run.sh
1.为什么要在上机测序之前做PCR扩增? 测到的reads数取决于flowcell上长了多少cluster(1个模板链扩增出一簇分子),有多少cluster,理论上就得到多少...
第一步:编辑bashrc 编辑 ~/.bashrc 文件,第一个变量$LOCAL_APP根据自己情况修改,后面直接复制。 #local app path LOCAL_APP=...
图分为两部分: 1.左边 最左边亮度阶梯分布,不同高度代表PCR片段长度的不同,片段越短,跑的越快,为最下方的条带。片段越长,跑的越慢,为最上方的条带。最左边为一个参考条带;...
1.对不同的列进行不同的排序方式 sort -k1,1 -k2,2n -k1,1 表示对第一列进行字符串比较 1,1表示起始列为第一列,终止列也为第一列 -k2,2n 表示仅...
1. 实现目录下大批量文件的删除 当某个目录下存在大批量文件的时候,如果用rm 命令进行删除,会很慢; 解决方法: 先创建一个空目录 mkdir Blank 然后 rsync...
1. 按照时间查询文件 先touch 两个时间标记文件 touch -t 07120800 start #####07120800 代表的意思(月,日,时,分) tou...
1. awk命令实现文本内容行列转化 awk -F '\t' '{for(i=1;i<=NF;i=i+1){a[NR,i]=$i}}END{for(j=1;j<=NF;j++...
之前下载SRA的数据,使用 prefetch -v SRA --max-size 100G 下载数据,经常会出现下到一半就断网的情况;后来尝试使用wget下载,但...