yuxuan ICGC数据下载、表达矩阵整理相关内容详见小洁老师“生信星球”公众号的推文《ICGC数据下载和整理》,本整理过程也会用其整理的数据,详见: https://mp...
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已经跟着生信星球学习生信一个星期了,课程结束还有点舍不得,接下来我想谈谈这周的学习感悟和所得。 其实,关注生信星球,认识豆豆花花,都已经有很长一段时间了。还记得当时毕业设计忙...
前面提到过gdcRNAtools里面的ceRNA网络构建 构建鉴定ceRNA的标准有4个:(1)lncRNA和mRNA之间共享的miRNA数量;(2)lncRNA与mRNA的...
变异数据处理的总体思路如下: 1.数据下载 TCGA的突变数据有4个软件得到的不同版本: 这个可以在gdc的官网上找到,case选择KIRC,文件类型选择maf即可获得。 选...
Compiled: March 18, 2021 来源:https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html[...
前言 在论文阅读的过程中,经常遇到使用特异性(specificity)和灵敏度(sensitivity)这两个指标来描述分类器的性能。对这两个指标表示的含有一些模糊,这里查阅...
这是是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247497973&idx=2...
举个栗子 这是一组随机数,假如需要把这样的一组数字放在图里,是需要整齐统一的显示出来。基本上有两种思路,一是保留相同的位数,二是用相同格式的科学计数法表示。 方法一:统一保留...
需求 1.快捷查找ID对应的description,知道通路对应的编号是多少。2.找出某一个/几个通路里的全部基因,用来做单独的下游分析。 如果是要做KEGG的富集分析,cl...