发简信
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利用vcftools进行vcf文件过滤
在GWAS分析之前，一般需要对基因型文件进行过滤，包括：缺失率、MAF、杂合率、双等位、仅SNP等。 运用bcftools进行进行双等位和仅SN...
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linux 新建分区及格式化
fdisk最大只支持2T的硬盘，推荐gdisk进行分区 利用lsblk命令列列出新建的分区 再利用mkfs.ext4命令对新建的分区进行格式化 ...
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利用perl脚本统计标记的信息输入数据格式为： 利用该脚本，可以获得标记的等位信息、杂合率、MAF、缺失率及PIC值。
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perl处理fasta文件
在perl处理fasta文件是，需要每次读入一个完整的 序列头+序列，需要利用到 将perl默认的行分隔符切换为">"。 且从文件中第一次读取的...
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利用bedtools提取基因组指定区域序列
利用bedtools能够快速批量的提取基因组上指定区域的序列。 1. Example： 文件说明example_genome.fasta基因组序...
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通过perl脚本将fasta格式转换为KaKs_Calculator需要的AXT格式
这个perl脚本的作用是将Mega等软件比对保存的fasta格式的结果转化为KaKs_Calculator软件需要的AXT的输入格式。可以通过下...
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perl 中的单行、多行注释
example： #!/usr/bin/perl -w use warnings; =pod XXX .... =cut