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    基因组注释之从头预测

    1.创建本地BLAST数据库 使用makeblastdb程序,对上述FASTA格式的蛋白 质序列进行处理,建立本地BLAST数据库。makeblastdb -in ./uni...

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    基因组注释之同源搜索

    1.在uniprot下载fungi蛋白质序列 在uniport数据库输入taxonomy:fungi AND reviewed:yes查找蛋白质相关数据,总共找到33905条...

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    序列组装

    1.利用fastqc对模拟测序的序列进行质控分析 1.1 使用art-illumina模拟测序,生成高通量数据(art-illumina模拟测序) 1.2 安装fastq及质...

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    ggplot2之用图层画图(笔记二)

    图层 qplot的一个局限在于只能使用一个数据集和一组图形属性映射。解决的方法是使用图层,每个图层有自己的数据集和图形属性,然后可以通过附加包含数据的图层添加到图形中。qpl...

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    ggplot2之qplot(笔记一)

    qplot(quick plot)可以快速的创建复杂的图形,与plot非常像,学起来也容易得多。qplot前两个参数是x,y,代表所画对象的x轴坐标与y轴坐标。以ggplot...