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16S测序分析（五）用RandomForest寻找关键细菌导读 用随机森林“分类”的方法寻找16S测序数据中与分组有关的细菌。 一、数据准备 标准化细菌丰度表格式要求：不用放样本ID；最后一列放分组变量 二、R分析准备 三、随机森林...
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16S测序分析（一）菌属丰度表获取导读 Miseq 16S amplicon V3V4 PE300测序是目前菌群结构谱研究最为常用的测序手段。本文将以此类测序的下机数据为例展示“如何从Miseq测序数据中快速...
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第六章 群体多样性计算和测量6.1 Vdr−/−小鼠数据集 小鼠肠道微生物组数据(金等人)。(2015年)是从维生素D受体基因敲除(维生素D受体−/−)和野生型(WT)小鼠的粪便和盲肠粪便中产生的，具有...
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组间分析—T检验、R语言绘图T检验 在做微生物群落分析时经常要寻找不同群落之间的差异，我们会经常关心两个或者多个群落之间是否显著不同。就两个微生物群落间的比较，T检验是最常用的方法之一。 本次推文主要内...
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微生物多样性alpha分析看不明白？看这里！在微生物多样性分析的报告中主要包括五个部分：Alpha多样性分析、Beta多样性分析、物种组成分析、进化关系分析、差异分析，其中Alpha多样性分析是生态学中生物多样性的一个...
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009-vegan包做Alpha多样性分析网址 http://www.qplot.cn:3838/apps/009-vegan_diversity/ vegan包是一个全面强大的生态学分析包 diversity() ...
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Linux批量去掉文件名前缀
如下文件名批量修改： 202007070923_12345678.txt 202007070923_23456789.txt 使用命令： for name in 2020*....
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遗传学 博士研究生在读
