LET149 - 简书

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LET149

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Cell Ontology
https://cell-ontology.github.io/[https://cell-ontology.github.io/] https://obophenotype...

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CellRanger: FASTQ 文件的命名
测序数据的fastq文件不能随意命名，必须使用 cellranger count 要求的格式命名，否则软件不能识别和执行命名格式 SampleName_S1_L001_R1...

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scCDC: 去除 RNA 污染
GitHub:https://github.com/ZJU-UoE-CCW-LAB/scCDC[https://github.com/ZJU-UoE-CCW-LAB/scCD...

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Kiding127
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不知声
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Scrublet
GitHub: https://github.com/swolock/scrublet[https://github.com/swolock/scrublet] Tutori...

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DecontX
GitHub: https://github.com/campbio/decontX[https://github.com/campbio/decontX] https://...

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Ali Cloud: OSS
官方教程：https://www.alibabacloud.com/help/zh/oss/getting-started/get-started-with-oss?spm=...

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一尘墨香
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一尘墨香，资深网络作家，作品全版权开放，影视、动漫、有声书，
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交集和并集
交集：intersect() 并集：union()

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半小提琴图
https://zhuanlan.zhihu.com/p/717103565[https://zhuanlan.zhihu.com/p/717103565] gghalves...

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网络连接图
library(igraph)df <- read.table(text="GO:0002181 GO:0006412GO:0002376 GO:0002376GO:0005...

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sed-new
用于按行处理文本文件 https://www.runoob.com/linux/linux-comm-sed.html[https://www.runoob.com/linu...

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判断文件是否存在
if [ -f "file.txt" ]; then echo "文件存在"fi

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KEGG
0. 综合 https://zhuanlan.zhihu.com/p/135410211[https://zhuanlan.zhihu.com/p/135410211] 1....

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ggplot2 extensions
https://exts.ggplot2.tidyverse.org/gallery/[https://exts.ggplot2.tidyverse.org/gallery/...

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ClusterProfiler
http://bioconductor.org/packages/clusterProfiler[http://bioconductor.org/packages/clust...

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Visualization of Gene Ontology
Visualization of Gene Ontologyhttps://ar.inspiredpencil.com/pictures-2023/visualize-gen...

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个人介绍

Don't look for love, look for pizza.

Stay hungry, stay foolish.

Just do it.