背景 群体遗传学中测出很多个个体,得到了最终的SNP vcf文件,需要将其分成群体,看哪几个物种聚在一起。一般使用的软件就是STRUCTURE,但是STREUTURE运行速度...
安装并加载所需R包 基本用法 常用参数 加载并查看示例数据 基本数据格式: 前三列分别为SNP的名称,所在染色体,SNP的位置,后面每列为不同性状的P值,每个性状单独一列 默...
群体遗传学习专题 一之基础知识整理 群体遗传学研究对象是生物群体,这里的群体是指孟德尔氏群体。它是由同一物种组成的较大的有性繁殖群体。群体内的个体间是随机交配的,遵循孟德尔遗...
一、简介 Structure 是一个利用遗传标记推断群体遗传结构的软件。其功能包括推断群体数目,判断某个个体属于哪个群体,鉴别迁移个体及杂合体等。举个例子 上图中颜色的种类即...
转载自:https://www.jianshu.com/p/7d4e4948b623 群体遗传学基础知识 群体(Polulation):是指生活在一定空间范围内,能够相互交配...
一、中性学说 分子水平上,生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的,而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引起的,从而形成分子水平上的进化性变化或种内变异。分子演化的...
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究员田田文...
基因家族生物信息学分析 (1)基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通过基因复制进行物种特异性扩增,主要有染色体片段复制、串联复制和反转录子转座等三种形式,可能导致功能丢...