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  • 请问SNP数据怎么计算其遗传距离呢,如Nei,Roger等

    群体遗传学之个体间遗传距离及其计算方法

    01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...

  • PCA需要对snp进行LD过滤吗?

    主成分分析

    数据过滤质控之后 PCA分析(gcta) 利用R绘图

  • 所有的分析都需要对snp进行LD过滤吗?还是只有PCA不需要?

    2021.11.19 | 群体遗传结构、PCA、进化树

    常见的群体结构的分析方法有admixture分析、系统发生数分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 1)R语言绘图 admixture的可视化分为两种 2)pon...

  • 我想问的是文章里的perl .sh脚本可以分享在哪获取吗😂

    9.2 GWAS:关联分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出现的用于动植物关联分析的软件,还可以对进化模式以及连锁不平衡进行评估,功能非常强大,要说缺点,可能就是真的有点慢。 表型数据处理在下面这篇帖子中有介绍,这...

  • 脚本可以分享吗

    9.2 GWAS:关联分析——TASSEL(GLM/MLM/CMLM)

    TASSEL是最早出现的用于动植物关联分析的软件,还可以对进化模式以及连锁不平衡进行评估,功能非常强大,要说缺点,可能就是真的有点慢。 表型数据处理在下面这篇帖子中有介绍,这...

  • 又一大佬飞升而去,我辈望尘莫及啊!

    停更

    本想注销账号,后来随便翻了翻,还是没舍得。简书曾让我投入了很多感情,码文章也占用了我很多时间,就像自己养大的花一样,不是随便就能掐死的。停更大概一年了,主要原因是认识到自己有...

  • Python小试牛刀之爬取本地城市新房价格和地址

    利用xpath解析数据,requests库爬取房价,大致步骤如下: 获得目标网址,并观察网址源码; UA伪装,请求并获得响应; 解析标签数据; 循环遍历提取解析到的数据,并保...

  • 大佬这个shinyapp怎么打包成本地应用的?

    Qplottools分析画图工具(本地版)

    以前一直在维护一些R写的画图工具(www.qplot.cn),由于服务器的配置原因 ,访问速度很慢,上传大点的数据可能就会断线,用的人也不是很多,计划2020.7月服务器到期...

个人介绍
R语言小白一枚,遗传育种专业,不定期更新学习笔记。