
在单细胞转录组研究中,参考基因组的质量直接决定了基因定量的准确性。对于研究 Epstein-Barr 病毒(EBV)相关疾病(如 Burkitt...
写在前边 虽然现在是高通量测序的时代,但是GEO、ArrayExpress等数据库储存并公开大量的基因表达芯片数据,还是会有大量的需求去处理芯片...
100个GEO基因表达芯片或转录组数据处理 写在前边 虽然现在是高通量测序的时代,但是GEO、ArrayExpress等数据库储存并公开大量的基...
摘要 鼻咽癌的地理分布具有明显的特点,在东亚和东南亚尤为常见。过去十年的流行病学趋势显示,其发病率逐渐但稳步下降,死亡率也大幅降低。这些发现可能...
CibersortX网站是常用的工具,但是是网页上传数据,现在网页503打不开,而BayesPrism在PMID: 37717006[https...
尝试换一种文献阅读笔记分享方式,只记录重要结论,新技术,新方法,新知识 主要发现 鼻咽癌免疫逃逸的三种模式 部分肿瘤细胞降低MHC表达。 肿瘤细...
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学习完snakemake后写的第一个流程是RNA-seq上游定量和下游的质控和差异分析。 使用fastp处理fastq文件,在使用START比对...
The Snakemake workflow management system is a tool to create reproducibl...