刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性，推荐使用TPM。 read count和FPKM...
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简单小需求：如何将FPKM转换成TPM？
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2018-09-30 如何理解survivalROC包的统计学原理生存分析中的ROC是怎么来的，ROC是对二分类资料的评价指标，那对于生存资料呢？ 首先我们分析生存资料的特点：（1）包含有结局和时间两个方面的信息。（2）结局资料一般为二分类...
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TCGA TOBACCO_SMOKING_HISTORY含义在UCSC Xena下载的临床信息中有tobacco_smoking_history这列信息，从1到5，知道是跟吸烟有关但不知道什么数字含义，google查到可能的解释 Li...
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机器学习中的样本不平衡问题在机器学习任务中，我们经常会遇到这种困扰：数据不平衡问题。 数据不平衡问题主要存在于有监督机器学习任务中。当遇到不平衡数据时，以总体分类准确率为学习目标的传统分类算法会过多地...
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GEO数据库简介（2018-06-03）[转] GEO数据库--检索界面及检索结果简介 原文：http://baijiahao.baidu.com/s?id=1575064181962032&wfr=spider&...
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Bioconductor 分析芯片数据教程
这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在这里，教程条理清晰，对我理解芯片数据分析流程帮助很大，就把它翻译了过来。 ...
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用R分析芯片实战（上）刘小泽写于18.9.10实战上从数据下载到差异基因的获得、初步作图实战下进行富集分析，使用数据库进行注释在此感谢jimmy的limma包等教程 1 下载芯片数据 使用Fabb...
