MiSeq测16S文库时,为什么要加PhiX? 测定混合微生物群的16S的若干个片段,从其可变区的序列来进行菌落组成分序,已是很常用的实验方法。 自从MiSeq测序平台推出P...
MiSeq测16S文库时,为什么要加PhiX? 测定混合微生物群的16S的若干个片段,从其可变区的序列来进行菌落组成分序,已是很常用的实验方法。 自从MiSeq测序平台推出P...
1.问题 学习Python是目前十分火热的一个领域,但是Python3和Python2之间的切换和选择经常使人烦恼,多版本的Python之间经常会有冲突。解决这一问题的一个好...
下载原始测序数据: 在GEO数据库搜索GSE87182, 这里没有直接给出ftp地址,需要先从BioProject找到SRA号,可以得到RNA-Seq的SRA的accessi...
很明显,得到了表达矩阵之后,根据上面的样本信息,可以按照年龄,性别,取样部位来进行分组找差异。可以参考:https://github.com/jmzeng1314/my-R/...
SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 这几个步骤而已,中间穿插一些质控的手段,每个步骤选择好合适的软件即可。可以参考:一个植物转录组项目的实战 http://www...
前言 实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,入门请统一用htseq-count,对每个样本都会输出一个表达量文件。需要用脚本合并所有的样本为表达矩阵。参考...
作业要求 1.实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,入门请统一用htseq-count,对每个样本都会输出一个表达量文件。2.需要用脚本合并所有的样本为表...
要求 实现这个功能的软件也很多,还是烦请大家先自己搜索几个教程,入门请统一用htseq-count,对每个样本都会输出一个表达量文件。需要用脚本合并所有的样本为表达矩阵。参考...
还在用M$ Powerpoint?太out了,当然是个人都知道ppt有多out,可别以为Keynote,或者Prezi就不out了。下面列举的的工具大多在效果上不弱于这些收费...