前提：基于cluster的差异基因原理：超几何检验，找出与整个基因组背景相比，在显著性差异表达基因中显著富集的GO、KEGG条目(p<0.05：一般说明这个条目是有差异的) ...
IP属地：广东
-
单细胞-KEGG/GO富集分析（补） -
单细胞-KEGG/GO富集分析
前提：基于cluster的差异基因原理：超几何检验，找出与整个基因组背景相比，在显著性差异表达基因中显著富集的GO、KEGG条目(p<0.05：一般说明这个条目是有差异的) ...
-
单细胞-差异基因分析背景前提：1：一个Cluster和剩下的所有细胞的差异分析，反映的是各个Cluster的特征；2：组间差异分析（类似经典组学差异比较；需要样品送齐） 意义：1：找出每个聚类中...
-
samtools—手册
官方手册：http://www.htslib.org/doc/samtools.html[http://www.htslib.org/doc/samtools.html] S...
-
IS安装时遇见的问题
用OASIS 的IS预测需要老版本的python2.7和biopython1.76等环境（OSIA官网下载的操作要求指南如下 ） Requirements• Python 2...
-
mRNA-seq学习（二）：Bowtie2比对
1. 比对之前需要考虑哪些问题 1. 选什么作为参考序列 基因组序列既能做表达定量，还能发现新的基因和转录本 转录本序列（CDS / cDNA / 基因集）表达定量 2 gf...
-
细菌基因组拼接（简）从Genome Announcements上找出编号为SRR14817168的细菌基因序列 1.先创建SSR_test目录（进入） 2.再用prefetch下载到当前目录
-
linux下修改环境变量（简）每次安装新的软件时，我们都习惯于设置环境变量 如： tar zvxf /disk/shares/quast-5.0.0.tar.gz -C ~/Biosofts/ #这是下载...
