请问一下，hommer的参考基因组除了库中的那些，想要用其他物种怎么构建呢？
利用HOMER预测目标序列的motif（从运行程序到结果解读，以及注意事项）关于查找motif，目前有很多种软件可以进行预测。我所在的实验室通常使用FIMO（MEME套件里的一个），但是有很多文献里也提到了HOMER这个软件，并且不乏一些影响因子很高...
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使用GEMMA进行GWAS分析
GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合线性模型的GWAS分析软件。相比较...
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文献笔记：使用MutMap揭示水稻中重要的农业基因Genome sequencing reveals agronomically important loci in rice using MutMap Abstract In...
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import re
import os
with open("C:/Users/radiomumm/Desktop/sucai/all+nnj.fa","r") as fa_f,open("id.txt","a") as id_w:
content=fa_f.readlines()
for i in content:
res=re.match(">",i)
if res:
id_w.write(i)自学生信Python（第七天）|提取序列的ID
提取序列的ID 本人是一枚生物学的学生，由于对生物信息学特别感兴趣，于是想自学生物信息学（新手莫怪）。了解到生物信息学要有编程基础，尤其是要会一门编程语言，例如：R语言、Py...
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import math
def deltaG(ADP,P,ATP):
R=0.00831
T=298
G0=-30.5
deltaG=G0+R*T*math.log(ADP*P/ATP)
print(deltaG)
deltaG(1.8,5,3.5)自学生信Python（第一天）|计算ATP水解的吉布斯自由能
自学生信Python（第一天）|计算ATP水解的吉布斯自由能 本人是一枚生物学的学生，由于对生物信息学特别感兴趣，于是想自学生物信息学（新手莫怪）。了解到生物信息学要有编程基...
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请问4个样品的vcf文件中的亲本结果没有用是为什么呢？
使用QTLseqr进行BSA-seq分析
QTLseqr是一个用于BSA-seq的R包，它能够读取GATK输出结果进行过滤，最终使用SNP-index和G 统计值的方法进行定位。我们这次尝试使用这个R包来替代我们自己...
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QTLseqr包实战
偶然发现有个R包可以做相关的QTL 分析。拿来试试。 首先 安装,参考官方文档https://github.com/bmansfeld/QTLseqr. 第一步，如果没有安装...
