GSEA-analysis 1.加载数据 载入前一步分析得到的表达矩阵 2.批量相关性分析 将第一行目的基因跟其他行的编码基因批量做相关性分析,得到相关性系数以及p值。 3....
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GSEA-analysis 1.加载数据 载入前一步分析得到的表达矩阵 2.批量相关性分析 将第一行目的基因跟其他行的编码基因批量做相关性分析,得到相关性系数以及p值。 3....
一、首先需要知道以下几个知识点: 详细内容请参考:http://samtools.github.io/hts-specs/SAMv1.pdf 1.1-based coordi...
笔记主要内容:1~3代测序技术,fastq文件 & FASTQC (1)测序技术 1、一代测序技术:Sanger Sequencing 测序条件:需要有足够的量的单链DNA,...
写在前面 这篇文章仍然来自几篇文章及自己平时的积累,主要阐述关键基因和hub基因。很多人误以为hub基因就是关键基因,甚至有人认为差异表达基因就是关键基因。在正式看本文章之前...
一 结果文件说明 1 VCF (Variant Call Format)是储存Variation结果的文件格式 该文件的#列为文件的详细解读信息 2 *.hg19_mul...
结果文件的解读 输出文件1:*.variant_function 第一个文件包含所有变异的注释,方法是在每个输入行的开头添加两列(例如,第一行下面的“intergenic ...
一、人类基因组有多大 参照UCSC提供的hg38版本,也是目前常用的人类参考基因组http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38...
刘小泽写于2020.5.6首先是ChIP-seq分析的前言介绍部分:1:了解ChIP-seq的实验流程2:继续了解ChIP-seq3:关于ChIP-seq的实验对照与偏差来源...