不会消失,你后续重新定义Idents为你要的组分就行
单细胞多样本混合Seurat对象取部分样本下游分析###肿瘤样本提取 Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定义要取的类别 sub_tumor<- subset(seur...
不会消失,你后续重新定义Idents为你要的组分就行
单细胞多样本混合Seurat对象取部分样本下游分析###肿瘤样本提取 Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定义要取的类别 sub_tumor<- subset(seur...
前情提要: SPATA:基因集驱动的空间转录组分析框架[https://www.jianshu.com/p/81ce67b27529]enrichplot||基因富集结果可视...
Dotplot画出只有灰色是因为你命名的分类样本中有下划线。低版本的Seurat无法识别; 可选择将下划线替换重新画图即可
###肿瘤样本提取 Idents(seurat_obj) <- "orig.ident" ##Idents函数定义要取的类别 sub_tumor<- subset(seur...
T 细胞(全部):CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef(效应T细胞): 辅助...
TaoYan 简介 本文将绘制静态与交互式热图,需要使用到以下R包和函数:heatmap():用于绘制简单热图的函数heatmap.2():绘制增强热图的函数d3heatma...
作者您好,写的很有帮助,请教您FFPE样本(比如2年以上)的处理和储存过程引起的核酸损伤和降解,导致的生信分析结果中出现大量的GA/CT假阳性突变,这种要如何解决您有答案吗?
NGS二代测序技术与转化医学研究--1.肿瘤体细胞突变部分NGS肿瘤体细胞突变检测 样本类型:组织样本(新鲜组织+石蜡切片)以及cfDNA样本 可查阅2017年 FDA批准的FoundationOne CDx™和MSK-IMPAC...
Part1 数据下载 先去Korean Personal Genome Project下载了编号为KPGP-00001的数据。 先说一下KPGP吧,中文名叫韩国个人基因组计...
wtdbg2优点是速度非常快,安装使用都非常简单。用于nanopore及pacbio数据的组装 原理 首先要注意,wtdbg2不同于megahit等二代组装软件DBG的原理,...
https://bedops.readthedocs.io/en/latest/content/overview.html#why-you-should-use-bedops...