许多人问，为啥地热系统这么贵，实际上我们不必一定搞贵的，接下来我告诉你如何自制地热系统，而效果如同专业安装的。 你需要的技能：1. 水管安装 2. 挖掘能力（挖坑） 地热系统...
发简信
IP属地：北京
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P(Genotype|Data)是如何计算的？
HaplotypeCaller是怎么计算PL的？（VCF解密）
写在前面 PL是HaplotypeCaller等GATK变异检测软件在sample层面给出的注释，一般记录在VCF文件的FORMAT/sample一栏中。它代表了根据某位点变...
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htslib 的使用( C++ 处理BAM文件）
背景 在处理NGS 数据时，尤其是突变的检测。我们需要对bam 文件进行读写。 目前有相对方便的库 pysam 和 htsjdk ，这两个库提供的api 可以方便python...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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但是，貌似qualimap 对 比较大的bam， 速度奇慢。
比对文件BAM/CAM深度检测好用工具：Mosdepth
做完比对后，最直接的一个问题就是想知道：你的reads比对上了哪些区域没比对上哪些区域，有多少reads比对上特定的区域(该区域比对深度)。传统手艺一般可以使用bedtool...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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-subject_besthit 此参数确定你能输出 最有的一条吗？ 因为之前的blast结果，总是有bug， 总是不能输出最优的一条， 我在github中见到过此issue
linux BLAST序列比对 （nt/nr库）
安装本地blast序列比对软件，我们可以搜索一个查询序列定制数据库，例如想研究一个新测序的基因组，或者感兴趣的一组蛋白质序列。有时我们希望把程序插入到一个流程中，例如搜索一个...
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P(Data | Genotype) 写反了吧， 官网是P(Genotype|Data)
HaplotypeCaller是怎么计算PL的？（VCF解密）
写在前面 PL是HaplotypeCaller等GATK变异检测软件在sample层面给出的注释，一般记录在VCF文件的FORMAT/sample一栏中。它代表了根据某位点变...
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HZAU植科院农学本科毕业生<br>HZAU信息学院生信专业硕士毕业生<br>目前就职于国内某知名药企数据分析岗位<br>主要擅长SAS,R,Python,Linux,Shell,Power BI,Power automatic<br>对爬虫、网站搭建感兴趣<br><br>欢迎一起讨论呀~<br>简书不定时查看，有需要欢迎知乎私信:<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fcao-kai-30-84" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/cao-kai-30-84</a>
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优美胜于丑陋，明了胜于晦涩，简洁胜于复杂。<br>复杂胜于凌乱，扁平胜于嵌套，间隔胜于紧凑。
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北京基因组所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最优，搜索全局最优
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