上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sample-idr，接下来就是对p...
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第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化 -
学习下研究比较热的基因刘小泽写于18.12.25各种各样的基因研究，总有那么些经典的基因，如果不理解基因代表的生物学意义，那么做分析也是阻碍重重，所以，通过看文献查资料，希望可以补一下这方面的背景...
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简单理解RNA-Seq今天就当一个小故事看吧，看了statQuest，感觉讲的很棒，于是分享给大家原版视频后台回复“RNAseq”🤒花花今天效率太低写不完推送，于是我从晚上10点半开始帮她，有点紧...
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用tophat和cufflinks分析RNAseq数据(2018-05-28)
转自：http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=635619&do=blog&id=884213 用tophat和cu...
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tophat软件比对-实战（2018-05-29）1 比对的是：使用idba_ud拼接的AER314-4raw_data基因组与转录组数据。 2 bowtie2做index（bowtie2使用conda安装） 建索引：bow...
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单端测序与双末端测序问题
问题 Paired-End测序与Mate-Pair测序相对于单端测序有何优势？ Paired-End中的Read1和Read2到底是啥关系？它们是如何参与拼接和比对的呢？ M...
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UV-M6A 数据分析流程
fastq测序文件去除rRNA、mapping input（双端测序） for i in UV_12h UV_2h WT_2h WT_12h ; do bowtie2 -x ...
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【r<-生信|芯片分析】Bioconductor分析基因芯片数据我2017年用的域名失效了，我之前那个网站也没用了，所以这篇文章之前提供的链接跳转不过去。我现在直接在简书提供全文，然后新的链接是：https://www.shixiangw...
