个人在线学习笔记
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周转（repl）和嵌套（nest）对β多样性贡献的分解
Sørensen 指数和 Jaccard 指数作为配对样方间β 多样性的度量，使用 Baselga 在 2010 和 2012 年提出的 β 多样性分解方法结合 Legend...
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Fragstats 部分使用方法STEP1 数据准备 1 地图准备 剪裁好的并赋值好的.tif格式地图 注意：地图的坐标系要设置成投影坐标系， 不要设置成地理坐标系。 因为地理坐标系的图每一个格的像元值太...
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《数量生态学------R语言的应用》第二版阅读笔记1赖江山老师《数量生态学------R语言的应用》第二版阅读笔记1 本次是第一章绪论和第二章绘图部分 绪论 生态学（Ecology）是研究有机体及其周围环境相互关系的科学。 读...
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R: ggtree (一) base导读 ggtree由R语言大神Y叔纸笔，于2018年发表在Molecular Biology and Evolution杂志上，现引用已达407（2019.10.10 goo...
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R使用笔记: heatmap.2绘制热图笔记内容：热图的应用意义包的安装scale的作用作图细节：系统发生树，label, color key的问题等补充：添加多行ColSideColors补充：heatmap.3...
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99-非监督学习之hclust分层聚类k-means 输出为扁平的聚类结果，分层（层次）聚类输出为树状的聚类结果，当数据为多层级结构时适用。层次聚类(hierarchical clustering)基于簇间的相似...
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R语言计算β多样性指数及分析计算β多样性指数需要用到phyloseq包。它的安装方式不同于简单的install.packages（“phyloseq”） 有两种方法可以安装 1.先安装BiocManag...
