什么是Phasing？ Phasing，或者说Genotype Phasing，它的中文名有很多：基因定相、基因分型、单倍体分型、单倍体构建等在不同的语境下都有人说过。但不管...
发简信
IP属地：天津
-
人类基因组的Phasing原理是什么？ -
「r<-配置」Rprofile：R 全局设置
与文章 【r<-安装|方案】Windows R安装与配置 相关。 存储在 ~/.Rprofile 中的内容是一个 R 脚本，它会在 R 启动时自动运行，所以可以作为全局的配置...
-
5、RNAseq(5)--reads count(htseq-count)与基因注释（bioMart）理论基础 在上篇的比对中，我们需要纠结是否真的需要比对，如果你只需要知道已知基因的表达情况，那么可以选择alignment-free工具（例如salmon, sailfish...
-
4、RNAseq(4)--Hisat2进行序列比对及Samtools格式转化概况：使用处理后的fastq文件和基因组与转录组比对，确定在转录组或者基因组中的关系。在转录组和基因组的比对采取的方案不同。分别是ungapped alignment to ...
-
华西师兄倾情推荐|小白学机器学习的经典书籍和资源这都有作者简介 本文作者大可，四川大学华西医院肿瘤中心科研搬砖工，研究兴趣包括机器学习在高维组学问题中的应用，预测模型的开发与验证。已发表多篇生信和机器学习相关sci文章。 编辑审...
-
R小姐：mice 多重插补
答应大家今天要写一写关于多重插补的文章。查阅了很多资料，发现了一篇非常棒的英文文献，翻译给大家。 附上原文链接： 文章名称：mice: Multivariate Imputa...
-
特异度（specificity）与灵敏度（sensitivity）前言 在论文阅读的过程中，经常遇到使用特异性（specificity）和灵敏度（sensitivity）这两个指标来描述分类器的性能。对这两个指标表示的含有一些模糊，这里查阅...
-
倾向性评分匹配完整实例（R实现）倾向性评分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在随机对照试验(Randomized controlled trials,RCT)中用于衡...
-
1.GWAS：原理与目的全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study， GWAS）是以连锁不平衡（LD）为基础，利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记，鉴定与复杂性...
