木小亘

@小试管 我也新手，请教这个count matrix是10X输出的哪个文件呀？

python分析单细胞数据，多细胞去除的模块

hi，各位道友，上次我们介绍了R包DoubletFinder用于去除多细胞那么python是否也有类似的模块去除多细胞呢，答案是有的。这次我们就来使用一下python模块去除...

单细胞空间交响乐

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木小亘

软链接这个绝了

处理conda安装工具的动态库问题——解决记录

问题记录 在conda的某工作环境下使用rmats2rmats2sashimiplot作图的时候，发现有一个报错：无法找到libcrypto.so.1.0.0，我查看了游一下...

面面的徐爷

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木小亘

在数据分析过程中，仅仅涉及一张表格的情况是非常少见的，我们经常需要联系到其它表格的数据，整合这些表格的信息。这时我们需要常见的三类操作来完成。 合并连接：根据观测合并表格 筛...

木小亘

谢谢博主，我也是空格的问题

Python pandas merge不能根据列名合并两个数据框（Key Error）？

折腾 数据分析用惯了R，感觉pandas用起来就有点反人类了。今天用python的pandas处理数据时两个数据框硬是合并不起来。 我有两个数据框，列名是未知的，只能知道索引...

生物信息与育种

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木小亘

在安装samtools过程中，总是会遇到“library "libcrypto.so.1.0.0" not found “，此时，我们可以通过以下方式“欺骗”samtools...

木小亘

#Perl IO是自带的话，为什么我运行会显示无法定位PerlIO/gzip呢

[perl] 通过模块或命令读取gz 文件

PerlIO模块 读写gz文件 命令行 读取gz文件 就是通过 zcat ,less 等支持gz 文件的命令 读取 gz 文件的内容； 参考自：Perl语言读取gz压缩文件p...

Silver_42ac

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木小亘

想问一下您有输入参数（如去polyx— -x等）显示undefined的情况吗？我遇到了好多次，但这些参数在Github上是有的，但在终端用fastp -h查看帮助文档时又没有包含在内

fastp参数说明

本文完全摘抄自简书的 使用fastp进行数据质控 仅为方便自己学习，如有侵权请提醒删除，谢谢！ 使用fastp进行数据质控 fastp是一款较新的数据质控软件，接触这个软件也...

一只烟酒僧

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木小亘

想请问老师，为什么我的fastp输出文件名是默认的，而不是我提前设置好的那种呢？

GWAS走起~（2 fastqc、fastp）

Step four： 对从公司送回来的原始数据raw data预处理，至于问什么要进行这一步，通俗点讲就像是炒菜，直接从地里拔出来的青菜是不能直接用的，而正规的程序，至少...

roguish读书人

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木小亘

我发现我fastq的第一行在illumina_instrument.py中也找不到对应的测序平台，我应该怎么知道自己的测序平台呢？

2、RNAseq(2)--测序原始数据处理（Clean data）

1、fastq文件 一般我们从公司里得到的原始测序数据都是属于fastq.gz文件, .gz是一种压缩格式的缩写，于是首先第一步是对这些压缩格式进行解压操作 解压好的文件即正...

莫讠

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