发简信
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我只是知识的搬运工~
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测序有关问题
1.为什么要在上机测序之前做PCR扩增？ 测到的reads数取决于flowcell上长了多少cluster（1个模板链扩增出一簇分子），有多少cluster，理论上就得到多少...
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北京基因组所研究生在读，实验&生信小蜗牛一只。欢迎一起讨论呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库
DNA甲基化作为表观遗传的一种标记，在生长发育和疾病发生过程中扮演着重要角色。随着大规模甲基化研究的进行，积累了大量疾病相关的甲基化数据，DiseaseMeth就是一个保存了...
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iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多组学联合数据库
在NGS飞速发展的时代，有大量研究通过GSWA的方法，阐述了SNP于疾病之间的关联; 也有学者利用WGBS，RRBS, 甲基化芯片等方式研究DNA甲基化与疾病之间的关系。不过...
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MethyCancer : 癌症相关的甲基化基因数据库
癌症作为人类健康的头号杀手，引起了科研工作者的官方关注。鉴于DNA甲基化修饰在肿瘤中的重要作用， MethyCancer数据库整合了DNA甲基化数据和基因表达谱数据，将癌症与...
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MethHC: 整合了癌症相关的甲基化与基因表达谱数据的数据库
在MethHC数据库中，提供了18种癌症相关的DNA甲基化，microRNA表达谱和基因表达谱的数据，这里的数据来源于TCGA数据库。同时采用线性回归的方法计算甲基化和表达谱...
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NGS - Alignment 序列对比Introduction Resequencing 重测序 [NIBI] Resequencinghttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/probe/doc...
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用泊松分布解释 NGS 测序数据的 duplication 问题
tags： NGS duplication 不管从哪个角度看我们都希望测序仪产出的数据中 duplicate 率尽量低。怎样降低 duplicate 率？ 构建文库时，核酸提...
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NGS-概念解释+测序过程对二代基因测序的有些概念还是不太清楚 Illumina 平台 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3178052/The...
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NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
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NGS的临床应用（二）近日在 Archives of Pathology & Laboratory Medicine 杂志上发表了一篇题为Review of Clinical Next-Gener...
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NGS的临床应用（一）近日在 Archives of Pathology & Laboratory Medicine 杂志上发表了一篇题为Review of Clinical Next-Gener...
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分析记录 | 差异分析和KEGG GO物种Verticillium dahliae Kleb 1.deseq2差异分析 只有count数据。按照count数据建立col data表格。 因为col data表格只...
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Sanger 测序，NGS 测序，数据分析
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