1.计算亲缘关系矩阵 2.单性状LMM GWAS分析 3.多性状LMM GWAS分析 4.先填充缺失表型，再做LMM GWAS分析 5.贝叶斯稀疏线性混合模型
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3.2 GWAS：最佳线性无偏估计量——BLUE值计算（多年单点有重复）
GWAS中使用均值、BLUP值还是BLUE值，邓飞老师有两篇帖子进行了介绍，链接如下，根据我的数据，我选择了BLUE值。在这里提醒大家，不要一上来就忽略所有warning，很...
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基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)BSA作为基因组学中基因挖掘的三板斧之一，最大优点是高效、经济、简便。通过选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样，然后比较不同极端混样池之间的多态性并结合表型进行目...
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真核生物的转录起始（2）课件来源：7.3.2 真核生物的转录过程（2）_哔哩哔哩_bilibili[https://www.bilibili.com/video/BV1h741157zC?p=84]...
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开门见山：GWAS 总体流程理解版 - 简书[https://www.jianshu.com/p/c0a032a8e7d5]全基因组重测序基础及高级分析知识汇总 - 知乎[h...
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1.GWAS：原理与目的全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study， GWAS）是以连锁不平衡（LD）为基础，利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记，鉴定与复杂性...
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VS code 配置miniconda ；python\perl 虚拟环境的搭建大纲 VS code的安装与设置 VS code的独立工作区环境 miniconda安装并在VS code中载入 使用miniconda配置env和增加channel 在en...
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ggplot2中facet_wrap( )的高阶用法介绍ggplot2中facet_wrap( )函数中labeller 参数的用法 labeller参数，可以使用它来处理太长的facet标签 同时显示变量名称与因子值 显示因...
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一文读懂比较基因组学
随着基因组测序爆炸性增长，比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢？比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之...
