我觉得处理任何事情,不仅要做到“知其然”,还要做到“知其所以然”。在做事情时,如果仅知道低头蛮干,不知道抬头看路;只知道跟着“牵牛绳”的方向,在鞭子的抽打下前进或停止,那么最...
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HMMER是基于隐马尔可夫模型,用于生物序列分析工作的一个非常强大的软件包,它的一般用途是识别同源蛋白或核苷酸序列和进行序列比对。与BLAST、FASTA等序列比对和数据库搜...
在基因家族分析中,hmmsearch用来在很多候选序列中寻找具有某种基因家族结构域的蛋白。在寻找时,需要提供基因家族对应的隐马模型。前段时间给大家介绍了pfam数据库更新后h...
叶绿体基因组注释是非常重要的一步,注释的合理与否直接影响后续分析的正确性,例如密码子偏好性分析、选择压力分析等等。 STEP 1 获取初始的GB注释文件 使用GeSeq进行注...
1. Genome Scope2.0介绍 仓库地址:tbenavi1/genomescope2.0: Reference-free profiling of polyploi...
FastK介绍 仓库地址:thegenemyers/FASTK: A fast K-mer counter for high-fidelity shotgun dataset...