最近在编写全新的ATAC-seq流程，看到一个非常好的文献《From reads to insight: a hitchhiker’s guide to ATAC-seq d...
发简信
IP属地：广东
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文献分享：从原始数据开始一步一步分析ATAC-seq
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被12本期刊秒拒一点都不冤，谁让你做这些套路的纯生信
你的纯生信论文被多少本期刊秒拒了？有的人说一本，有的人说3本，有的人说5本，有的人说8本，有的人说10本，更夸张的，有的人说自己的纯生信被12本期刊秒拒。被12本期刊秒拒了？...
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单细胞数据资源 | Nature子刊：『中性粒细胞』稳态和炎症状态下的单细胞发育和异质性图谱
2020年7月，来自中国医学科学院血液病医院（中国医学科学院血液学研究所）、哈佛大学医学院、北京大学生命科学学院等机构的研究人员在《Nature Immunology》发表了...
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链特异性建库如何区分正负链？写在前面的废话 经过这两周意外的断更，我明白了一个道理，人都是具有惯性的…… 两周没写公众号，我似乎都习惯了懒惰，文章不想更了，笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑，一...
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双端测序中read1和read2的关系在跟着健明老师学习生物信息学的过程中，少走了很多弯路，躲过了很多坑，在指导下浅尝过一些。但是自己常常扣原理，又双叒叕落坑，百思不得其解。以下是之前遇到的问题，今天整理带大...
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RNA-seq分析：从fastq到差异表达基因
RNA-seq的数据分析是比较简单基础的分析，大概流程就是处理下机的fastq数据（trimmomatic），比对到人类基因组（hisat2）然后统计每个基因上出现的coun...
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单细胞转录组学习笔记-6-得到表达矩阵后看内部异质性刘小泽写于19.6.18、23-第二单元第四讲：得到表达矩阵后看内部异质性 笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的分析技术课程链接在：h...
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单细胞免疫组库：TCR基因重排原理和TCR测序建库方法单细胞测序方法和原理系列： 1. 单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
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解决机器学习问题的标准步骤及其范例程序解决机器学习问题的标准步骤如下： 获得训练数据。 定义模型。 定义损失函数。 遍历训练数据，从目标值计算损失。 计算该损失的梯度，并使用optimizer调整变量以适合数据。...
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利用AI绘制精美的基因代谢通路图（基础知识）年中总结接近尾声，我们学一学基础知识，利于我们文章的发表 通过KEGG富集分析得到通路图非常模糊，无法直接用于文章发表。而我们在一些大佬的文章里看到的通路图却非常漂亮，如下，...
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CNS图表复现18—细胞亚群的比例展示
本文是参考学习 CNS图表复现18—细胞亚群的比例展示[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI1Njk4ODE0MQ==&mid=22474...
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思路清奇SCI:11.免疫预后+候选药物分析（4+分）发表杂志：Molecular Therapy: Oncolytics PMID: 知识点 PGs：pediatric gliomas 儿童胶质瘤 CBTTC：Children...
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CRISPR-Cas9基因编辑1--背景介绍及gRNA设计（上）简介和前期文章 我对之前的所有教程进行了再次详细的总结 前言： 每当我们接触新事物时，都忍不住问如下图所示之哲学三问（当然有时候问的是，这是什么？可以吃吗？怎么做？）： 由于...
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翻译的挺好的，感谢up主，让我们能短时间看一篇综述。UP主是不是在B站也传了视频，教计算临床试验样本的？
2021年最新Nature综述：分子免疫治疗时代肝细胞癌的局部治疗（第二部分：消融治疗）
题目：Locoregional therapies in the era of molecular and immune treatments for hepatocellu...
