测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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TCGA转录组差异分析后多种基因功能富集分析：从GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID转换） -
基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文目录本系列文章的目的：我将首先简要介绍一下ggplot2的基本思路，然后使用前面介绍的TCGA数据模仿articles中的图片进行数据可视化。 其他文章一览：从TCGA数据库下载...
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如何批量预测转录因子
如何批量预测转录因子 前一段时间看文献，想预测转录因子，搜索发现Y叔的clusterProfiler的R包具有批量预测转录因子的功能，用R包自带的数据，可以运行，但是用自己的...
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clusterProfiler: 分析+可视化GO和KEGG富集的转录组R包写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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GEO数据挖掘小尝试：（三）利用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler 是业界大神Y叔写的一个R包，可以用来做各种富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）、Reacto...
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20个转录组知识点-你必须知道！
随着测序成本的不断下降，转录组测序分析已然成为生物学及医学研究不可或缺的技术手段。 但是，对于大多数初学者来说，会遇到各种各样的问题。这里，小编就给大家重点介绍一下转录组测序...
