今天跟大家分享的工具可以是用来处理带有分子标签(Unique Molecular Identifiers，UMIs)和细胞条形码(cell ba...
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umi_tools for dealing with UMIs and cell barcodes -
MetaCell： scRNAseq聚类和细胞类型注释的R包为了更好的展示代码，我把之前的帖子重新整理成markdown的格式，方便大家观看！！！ scRNAseq可谓是目前科研界研究细胞异质性的...
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markdown： 你值得拥有的轻量级标记语言Markdown是一种轻量级标记语言，内容是代码与文本的混合，类似且兼容HTML，但语法比HTML简单。学起来很简单，基本没有什么障碍，学会...
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NCBI下载SRA数据的4种方法作为生命科学的从事者，不论是老师或者学生都应该用过NCBI((National Center for Biotechnology Infor...
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html如何给图片添加动态的文字说明
前言 之前发过一个html5的学习帖子《html5 学习总结》，帖子内容主要是介绍一些html的基础概念和注意事项如盒子模型、高度塌陷问题。...
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metacell： scRNAseq聚类和细胞类型注释的R包
scRNAseq可谓是目前科研界研究细胞异质性的有效手段，正处于如火如荼的阶段。单细胞分析一个很重要目的就是为了确定细胞的类型。说到单细...
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Viral-Track： 揭示重症COVID-19病人的感染特征前言 今年的新冠可谓是来得触不及防，对各个行业多带来了很大的影响。庆幸的是在全国人民一起配合的努力下，国内的疫情被控制的很好，相比于海外来说...
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python脚本截取fastq序列
前言 最近在学习单细胞方面的知识，遇到了一个小的需求就是截取需要的fastq序列。先来说一下为什么有这个需求，一般来说单细胞的测序文件有三个...
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R： 向量(vector)元素操作总结
R语言中的向量可以说是经常使用到的数据数据类型，所以总结了一下向量的相关操作，包含创建、访问、插入和删除、修改值等。 1、向量的创建 这里介...
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scRNAseq：h5文件转化为matrix表达矩阵前言 今天想跟大家分享一下单细胞分析中的一个需求，就是如何将h5的表达量文件转化为常见的表达矩阵。大部分情况下，我们是不需要用到这个需求，因...
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