发简信
IP属地：陕西
-
STAMP使用小技巧 | 空转的可解释性空间感知降维STAMP (Spatial Transcriptomics Analysis with topic Modeling to uncover s...
-
MultiQC高级用法：生成自定义报告MultiQC作为NGS数据QC报告的整合工具，目前已支持165个生信工具的报告整合，一键就可以轻轻松松将多样本的QC结果整合起来并生成网页报告...
-
CytoTRACE2：细胞分化潜能的预测效果不错CytoTRACE2是一个新颖的深度学习框架，旨在处理单细胞潜能评估的复杂性，同时实现直接的生物学可解释性。该框架的核心是一组基因集二进制网络 ...
-
Seurat用来分析bulkRNA，这就是降维打击Seurat作为知名的单细胞数据软件，真的是非常棒，让分析过程变得简洁高效，无需花费很多的学习成本便可以上手。虽然该软件是为单细胞数据设计而来，...
-
利用数据库的marker手动注释细胞类型单细胞分析前期很重要的一步是细胞类型注释，这一步看似很简单，有时候做起来却是最耗时的一步。如果数据很好，用经典的或者文献里的marker很轻松就...
-
cellrank v1/2 | 细胞分化轨迹推断，scanpy团队出品CellRank是由出品scanpy的Fabian J. Theis 团队开发的单细胞轨迹分析工具，主要用于推断细胞命运的动态变化。传统轨迹推断...
-
-
-
scanpy差异结果哪里出了问题用scanpy做差异分析的时候，发现一个奇怪的现象，如果指定了reference参数，即使设置了pts参数来计算基因的在细胞群里面的表达比例，当...