Seurat作为知名的单细胞数据分析框架，虽然很好用，但在大数据集一直存在速度上的短板，尤其在FindAllMarkers。所以其一直也在试...

好看的图当然会锦上添花，单细胞美化的包很多，也各有特色，不妨收藏几个，方便以后事半功倍地画出漂亮的图。 scplotter[https://pw...

  数据处理时经常需要做各种处理，如标准化和归一化，在R里面可以借助scale函数来轻松完成。默认情况下，该函数做的事情可以用下面的公式概括：其...

  每当需要做热图的时候，首先想到就是pheatmap。记不清啥时候第一次使用该包了，但从那以后这就是画热图的第一选择了，因为无论是功能，还是颜...

  Seurat的FeaturePlot可以展示基因在降维空间里各个分群的表达情况，也可以展示metadata里面的数据情况，例如基因集打分情况...

  分析差异翻译基因时，为了保证结果的正确性，除了使用Xtail软件外，也用riborex分析了一遍，该软件封装了常规转录组常用的三种差异分析框...

  ChIPseeker用来做peak注释体验感确实很好，所以也经常用，为此还特意包装了一个性化脚本方便命令行直接使用，后台也有不少人获取脚本，...

  基因翻译，即遗传密码从转录本到蛋白质的过程，也是功能基因能够发挥自身作用前的必经之路。基因的翻译效率收到很多因素的调控，这其中最直接的是基因...