Biomni一个登上主刊的通用型生物医学智能体，核心原理是构建一个“通用型生物医学AI代理”，其设计围绕两大支柱：一个统一的生物医学操作空间和一个灵活的通用型代理架构。 简单...
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biomni | 智能化的分析流程 -
pyscenic基因调控网络加速的可选方法pyscenic做转录因子分析时，GRN是限速步骤，数据大点就很耽误时间。此时，RegDiffusion就是一个加速选择。 以往从表达数据中推断GRN的方法常常难以应对数据的...
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PSGRN | 单细胞扰动数据专属的GRN方法基因调控网络 (GRNs) 对于理解基因如何协调细胞过程至关重要。如今大规模的单细胞扰动研究为GRNs推断提供了机遇，但目前许多方法未能充分利用干预信息。因此，作者提出了PS...
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Nature Protocols 手把手教你做scGPT模型微调scGPT关于细胞类型注释的预训练模型微调的文档内容详细而系统，但对于使用来说有点复杂，看着让人眼花缭乱。这样整个过程摊开在使用者面前，虽然调整的自由度很高，但也同时增加了复...
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DAVID做富集分析的生信工程师快捷用法功能富集作为生信分析的常规方法，做过分析的人都很熟悉。功能富集的软件也是相当的丰富。其中，DAVID作为功能富集的老牌网站认可度还是很高的，对于不熟悉代码的人来说，这样可视化...
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scGPT模型微调最佳操作指南本指南涵盖从数据准备到最终评估的完整闭环，并融入了差分学习率、二阶段冻结、值域裁剪等经过验证的实战要诀，旨在帮助您避开常见陷阱，高效训练出高精度的下游任务模型。 1. 数据准...
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scGPT细胞类型注释的预训练模型微调
scGPT关于细胞类型注释的预训练模型微调的代码过程如下：https://scgpt.readthedocs.io/en/latest/tutorial_annotation...
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scGPT模型做GRN分析也是不错的选择scGPT 分析基因调控网络 (Gene Regulatory Network, GRN) 的核心思路是：它不是在模拟基因间的线性相关，而是利用预训练模型从海量数据中学习到的...
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cellxgene远程或本地探索单细胞数据cellxgene是单细胞领域不可多得的资源，作为一个数据库里面目前包含了2124个数据集，囊括1117种细胞类型，共有156M细胞。除了人和小鼠外，还收录有Callithr...