单细胞分析前期很重要的一步是细胞类型注释，这一步看似很简单，有时候做起来却是最耗时的一步。如果数据很好，用经典的或者文献里的marker很轻松就可以定义出细胞类型，此时这一步...
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利用数据库的marker手动注释细胞类型 -
cnvkit分析CNV，batch真的好用
最近需要分析CNV，所以学习了一下cnvkit软件。不得不说，软件的文档写得真的很详细，能够感受到给予使用者的满满诚意。无论是最新的文档，还是网上相关的帖子，都会看到下面的这...
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telomere length and content estimating端粒是位于染色体末端的DNA的非编码重复序列，就像安全帽一样，保护着基因组。在人体细胞中，其初始长度为8-15kb，每复制一次，其长度便会减少50-200bp。当端粒长度达到...
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kallisto原理的图文详解，通俗易懂的专业内容最具吸引力看到一篇关于kallisto软件原理的文章，内容通过图文的形式详细地介绍了软件的工作原理，让读者能够直观地理解以便更好地使用软件，内容通俗易懂值得学习与分享。内容如下： ka...
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bwa mem 迷一般的参数最近被bwa-mem -T参数搞迷糊了，不明白这个参数是如何发挥效用的。根据软件帮助文档对参数的描述，可知其功能是过滤输出结果，于是乎想当然地觉得它的作用是过滤掉alignm...
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DNA甲基化Bismark、BSMAP流程跑起来日常掰虾 前面学习了DNA甲基化的基础知识，也了解了它的重要性，不知道的同学看这里，DNA甲基化知识概述[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz...