日常掰虾 前面学习了DNA甲基化的基础知识,也了解了它的重要性,不知道的同学看这里,DNA甲基化知识概述[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz...

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用scanpy做差异分析的时候,发现一个奇怪的现象,如果指定了reference参数,即使设置了pts参数来计算基因的在细胞群里面的表达比例,当提取差异结果的时候会发现并没有...
日常瞎掰 火山图作为展示差异基因的首选,可以说是生信分析常见的图形了。常规的火山图会在x、y轴方向上添加垂直参考线,以方便区分满足阈值的差异基因。常规的火山图这里就不多了...
pyscenic做为scenic的python版本,相比R版本实现了分析速度上的巨大提升,尤其是最耗时的共表达网络构建步骤。实测时间如下,数据集1 (4257 cell x ...
序 言 生信分析真的是跑下别人的软件就ok了么?很明显这样认为有些肤浅。先不说软件好不好用的事,即使勉强能够正常运行得到结果就万事大吉了么?这里也不讨论数据好坏的问题,得...
最近被bwa-mem -T参数搞迷糊了,不明白这个参数是如何发挥效用的。根据软件帮助文档对参数的描述,可知其功能是过滤输出结果,于是乎想当然地觉得它的作用是过滤掉alignm...
看到一篇关于kallisto软件原理的文章,内容通过图文的形式详细地介绍了软件的工作原理,让读者能够直观地理解以便更好地使用软件,内容通俗易懂值得学习与分享。内容如下: ka...
端粒是位于染色体末端的DNA的非编码重复序列,就像安全帽一样,保护着基因组。在人体细胞中,其初始长度为8-15kb,每复制一次,其长度便会减少50-200bp。当端粒长度达到...