新年快乐~ 1、chipseeker包的介绍: ①、南科大Y叔写的包,感谢②、主要是对peaks的注释和可视化 2、这次用的数据,是chipse...
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刘小泽写于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-...
跟着Cell学作图|7.富集分析(Metascape数据库) “实践是检验真理的唯一标准。”“复现是学习R语言的最好办法。” DOI: 10.1...
放在最前面的参考链接:给学徒的ATAC-seq数据实战(附上收费视频) 数据来源的文章: The landscape of accessible...
(由于以前的几篇文章被平台锁了且申诉失败,只好重发一下) 在看paper的时候,经常会有这种图: 这是从UCSC browser上可视化数据然后...
今天介绍和测试这款关联ChIP-seq、RNA-seq分析软件,BETA(Binding and Expression Target Analy...
上一步骤(第6篇:重复样本的处理——IDR)用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估,同时得到了merge后的一致性的peaks——sam...
BETA 网址: http://cistrome.dfci.harvard.edu/BETA/tutorial.html 功能介绍 数据准备: ...
常用id Ensemble id:由欧洲生物信息数据库提供,一般以ENSG开头,后边跟11位数字。如TP53基因:ENSG00000141510...
老大在群里出的题,说感觉这个热图很诡异,然后中间我自己没有用boxplot查看数据的表达量,对于数据不能有正确的认识,导致一开始的deg的log...
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