网络图 在传统的网络图里面，一般分为非权重网络和权重网络对于非权重网络： 非权重网络的特点是只能表示两个点之间是否有关系，单纯的“一刀切”，即只...

前言，今天刚好在群里看到有人问“请问10X一个样本测多少个G比较好”，群主给出了答复，但是我对300这个数怎么来的还是不理解，出于好奇心，于是去...

目录 1. 标准化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4. TCS1.5. Qua...

在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧，因此...

轨迹推断，顾名思义是推断细胞分化状态的一种方法，然而现行的轨迹推断的方法都不能将周期纳入其中，但是总会有人这样想，然后实现了它。 真的还是有几分...

前言 作为表观基因组的工具，MACS2是call peaks强而有力的工具，那么MACS call peak的基本统计学原理是上面呢？大至可以分...

最近在学习cellphoneDB，顺便写一个学习记录吧。 简介 CellPhoneDB是一个可公开获取的受体、配体及其相互作用的存储库。配体和受...

前不久小编接触了这样一个分析，给定基因表达矩阵后，通过自组织映射（Self-organizing map，SOM）技术识别其中的高表达基因集，以...

在研究基因表达谱或者蛋白表达谱时，经常会涉及到对时间序列的分析。例如，不同的基因或蛋白表达水平随时间表现出怎样的动力学特征，怎样挖掘潜在的时间特...