说在前面 相信大家在平时做富集分析时都会有这样的一个需求：如果能知道感兴趣的某条通路中各基因的调控关系，那么就能准确识别出hub基因；或者说找到...
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CBNplot：可视化富集通路中基因的调控关系 -
GSE120974多组学分析复现0.数据介绍 这是一篇发表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...
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跟着Nature学作图:R语言ggplot2环形堆积柱形图完整示例论文 A global reptile assessment highlights shared conservation needs of t...
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RNA编辑：相关数据库和分析软件REDItools数据库： 1.DARNED：https://darned.ucc.ie/包含大约42000个人类基因组坐标的信息。 2.RADAR：http:/...
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NCBI公共数据库下载10x单细胞数据进行上游分析的全流程参考生信技能书一文打通单细胞上游：从软件部署到上游分析[https://mp.weixin.qq.com/s/pQyUieRVXohY1enqj...
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网络生物学与人工智能 | Awesome-GNN
2020/7/9，第一次更新，本文将总结笔者的研究方向一"多组学智能医疗"的子方向"网络生物学与人工智能"的分支——图神经网络（Graph Ne...
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从「Read.fq.gz」到「SNP.vcf」？我用 TBtools 点点点就整完了~[准备花3天时间，写这个推文] 写在前面 前述提及，重测序数据分析上游常用软件三兄弟已经聚齐，于是所有用户可以在 Windows 下进行重测序数...
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iTAK：在线预测全基因组转录因子TF，转录调节因子TR与蛋白激酶PK前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子 (TF)、转录调节因子 (...
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qiime2R包整合qiime2和R可视化分析16s数据
背景：qiime artifact 是用于存储qiime2的输入输出以及相关的元数据，并提供结果是如何产生的信息，但是qiime2所产生的art...
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单细胞之轨迹分析-5：slingshot轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] ...
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