SeuratData SeuratData是一种使用R的内部软件包和数据管理系统以Seurat对象形式分发数据集的机制。它为用户提供了一种访问S...
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SeuratData内置数据集的安装使用
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「单细胞转录组系列」如何从稀疏矩阵中提取部分数据进行分析这一篇文章是回答知识星球中一位星友的提问，她的电脑内存有限，无法直接使用所有数据，只能分析部分数据。 数据来源: https://content...
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Scanpy数据结构：AnnDataAnnData是python中存储单细胞数据的一种格式 1. AnnData数据结构： 主要包含四个slots：X contains the e...
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AnnData对象处理AnnData是python中存储单细胞数据的一种格式，常用于scanpy。 1、认识结构 基本结构如下： 参考链接：https://cellg...
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scanpy分析单细胞数据R在读取和处理数据的过程中会将所有的变量和占用都储存在RAM当中，这样一来，对于海量的单细胞RNA-seq数据（尤其是超过250k的细胞量），即...
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Python单细胞测序分析教程 - 2| 下载测序数据并处理为scanpy可读取的格式本教程介绍了在GEO数据库中下载单细胞数据集的方法，并进一步处理为scanpy可读取的格式。 第一步：GEO数据库下载单细胞数据 NCBI：ht...
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单细胞转录数据分析之ScanpyScanpy 是一个基于 Python 分析单细胞数据的软件包，内容包括预处理，可视化，聚类，拟时序分析和差异表达分析等。https://gen...
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单细胞分析入门——一套经典的Seurat分析流程前几天看到周运来老师的一句话，放在这儿，与诸君共勉： 看到才能想到，想到才能做到，做到才能得到，得到才能失去，只有失去了才知道适不适合自己 好了...
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