参考1:https://www.jianshu.com/p/68f7b663c5ff[https://www.jianshu.com/p/68f...
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我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里呢?...
STAR 软件安装 软件的GitHub地址为https://github.com/alexdobin/STAR, 下载页面为https://gi...
原文来源:Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices...
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点: 速度快 准确度高 3'reads soft clip genomeLoad Loa...
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de ...
比较悲催的是现在下不了,查了很多没有找到解决办法 加上一个端口参数 -P 33001,貌似可以下载了(今天2019.5.23晚上在摸索下) 一、...
参考:碱基矿工生信学苑 通常我们可能会看到.cram,.sam,.bam等多种序列比对的文件,其实他们的本质都源于sam。bam 是sam 则是...
一、测试环境及工具 Linux(Ubuntu 18.04.1) Aspera (Aspera Connect version 3.9.9.177...
目的 一个新的物种(没有参考基因组)用Trinity从头组装得到的转录本fasta文件,需要将其转换成gtf文件 思路 用http://www....
专题公告
生信上游分析