前言——主要内容 这篇笔记是StatQuest系列笔记的第63节，这篇笔记跳过59节，60节，61节主要是因为第63节的内容是讲RPKM，FPK...
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StatQuest学习笔记24——RPKM FPKM TPM
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reads计数原理及featureCounts统计counts后的cpm和tpm计算摘录：生信技能树论坛 Kai statquest 要求：实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-cou...
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RNAseq01(hisat2-stringtie-ballgown/featureCounts)
1. Hisat2-featureCounts流程 1.1 shell-script001<hisat2_featureCounts.sh> 1...
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从spike-in到DESeq2：文库normalization
写在前面的废话 最近在处理一批RNA-seq的数据，里面混入了spike-in。利用spike-in矫正之后，样本A的基因表达量普遍比样本B的基...
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MAIT-液质联用代谢组学数据分析全能包@我的博客：有味 导读 目前用于代谢组学数据的液相色谱和质谱分析的工具只涵盖有限的处理步骤，而在线工具很难以可编程的方式使用。这篇文章作者给我们...
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单细胞测序（scRNA-seq）通关||数据处理必知必会单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[ht...
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R包——maftools 可视化神器背景介绍 随着癌症基因组学的进步，突变注释格式（MAF）被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变体。 癌症基因组图谱项目对30多种不同的癌症进行了测...
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无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biol...无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expr...
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转录组学习五（reads比对）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（...
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hisat2:比对基因组工具简介-转载原文链接：hisat2:比对基因组工具简介_生信修炼手册_传送门 由于测序仪机器读长的限制，在构建文库的过程中首先需要将DNA片段化，测序得到的...
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