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群体遗传
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    群体遗传学统计指标——种群核苷酸多样性

    理论 种群核苷酸多样性，顾名思义指的就是核苷酸多样性，值越大说明核苷酸多样性越高。通常用于衡量群体内的核苷酸多样性，也可以用来推演进化关系。计算...

    2.2 EwanH 1 33
  • pi, Fst, dxy, fd的计算

    有许多不同的统计量可以衡量差异选择的区域或基因渗入障碍的区域。这里介绍常用的四个统计量的计算： pi, 衡量遗传多样性 Fst, 衡量群体分化程...

    3.5 DumplingLucky 16 23
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    群体遗传学-选择清除分析

    一、中性学说 分子水平上，生物的演化或物种的进化并不是自然选择引起的，而是由中性/近中性的突变等位基因经过遗传漂变引起的，从而形成分子水平上的进...

    5.2 Zhigang_Han 1 47
  • 群体遗传学基础知识

    转载自：https://www.jianshu.com/p/7d4e4948b623 群体遗传学基础知识 群体（Polulation）：是指生活...

    5.0 Zhigang_Han 0 51
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    连锁不平衡（LD）分析。

    在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是非常常见的内容，同时也是关联分析的基础。在很多的遗传进化GWAS的文章中都会出现LD衰减或者block单...

    3.0 要快乐_更要经历山河 6 51
  • PCA的分析

    常用的工具 PCA分析中常用的工具有GCTA中的PCA模块，老牌的软件EIGENSOFT中的smartpca，还有很多最近推出的R包都能够做PC...

    3.5 lakeseafly 21 48 1
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    2021-01-03如何绘制选择性清除图（fst、pi、tajimad等）、）

    一、转载https://blog.csdn.net/yangl7/article/details/109323644 vcftools --vc...

    1.4 麦冬花儿 1 27
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    群体遗传学统计指标——群体间分歧度检验（Fst）

    基本概念 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。用于衡量种群分化程...

    2.9 EwanH 4 59 1
  • Fst的计算原理与实战

    概念回顾 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化...

    4.4 lakeseafly 16 54
  • vcftools

    vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具，其中很多过滤及计算功能我们可以自己使用perl或者python编写脚...

    2.5 oddxix 6 42