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微生物and代谢
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    Nanopore测序在宏基因组学中的应用

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    2.1 生信斑马鱼 0 13
  • QIIME2 分析微生物组测序数据

    #启动qiime2 source activate qiime2-2020.2 #创建工作目录并进入工作目录 wd=/mnt/d/Ju/ mkd...

    Tree_microbiome 0 2
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    生物数据格式 - gff/gtf

    格式 GFF是 general feature format的缩写，是储存基因结构信息的文件格式，主要是用来注释基因组。GTF全称Gene tr...

    3.2 半夜一更 1 8
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    一步步教你NCBI_SRA上传测序数据

    测序文章在审稿期间，审稿人往往需要作者上传原始数据至NCBI。而搜索引擎搜到的参考资料甚少，不得不边摸索边总结，几番倒腾终于上传成功。今天小编把...

    0.6 谢俊飞 0 11
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    KEGG Pathway通路二级分类汇总，轻松找感兴趣的通路

    做完通路富集分析，拿到几十条富集通路后，我们经常会寻找与“某关键词”相关的通路。例如与癌症相关的通路，与免疫相关的通路，与代谢相关的通路等等。单...

    1.9 微生信 0 16
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    从PCA、PLS-DA、OPLS-DA学习线性代数和矩阵

    一、一些基本的线性代数和矩阵的概念 1、正交: 正交定义: 正交是线性代数的概念，是垂直这一直观概念的推广。作为一个形容词，只有在一个确定的内积...

    人字拖拖不下来 0 4
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    SIMCA软件OPLS-DA分析

    http://www.biotree.cn/disnews.asp?anclassid=1&bookid=109[http://www.biot...

    佳名 0 2
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    统计检验

    参数检验和非参数检验的区别： 期刊文献中常规数据的主流统计检验方法分为两种：以T检验、方差分析等为代表的参数检验；以秩和检验、卡方检验为...

    0.7 ytbao 0 10
  • NCBI原始SRA数据下载

    下载NCBI数据，使用ascp命令是最快的，但是小编之前尝试用该命令下载SRA数据，查阅了百度上的各种参数，最后还是没有成功，可能是有个“墙”存...

    1.8 geneonto 0 7
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    Qiime2 数据导入

    在qiime2中进行任何数据分析的第一步永远是将数据导入qiime2并储存为qiime对象(.qza)。qiime2 接受导入的数据类型很多，包...

    0.5 吴十三和小可爱的札记 7 5

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