原文来源：Yang K, Wen X, Sablok G. Method for the Large-Scale Identification ...
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第4周：大规模鉴定phasiRNA的方法 -
常见NGS汇总github
https://github.com/crazyhottommy/
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一个完整的RNA-seq分析pipeline之HISAT2+ StrintTie+ Ballgown以及StringTie和Kallisto的比较(包括得到FPKM、TPM、readscounts)最重要的参考链接 https://pmbio.org/course/#module-06-rnaseq github链接：https://git...
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转录组学习八（功能富集分析）
转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（...
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The Power of RNA-seq
The Power of RNA-seq Wageningen, June 11-13 2018 Program Evaluation form...
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tophat2+cufflinks转录组测序（2)—去接头>比对>差异分析
在将原始数据和参考基因组数据处理好以后，就开始开始比对分析了比对所用到的参考基因组的索引文件和基因组注释文件都存放在hg19文件夹将sra文件解...
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转录组入门（8）：差异基因结果注释作业要求 我们统一选择p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因为显著差异表达基因集，对这个基因集用R包做KEGG/GO超几何分布检验分...
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转录组入门（7）：差异基因分析
作业要求 这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的vo...
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转录组入门（6）：reads计数
作业要求 1.实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表达量文件。2...
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转录组入门（5）：序列比对作业要求 比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2，并且搞懂它的用法。直接去hisat2的主页下载index...
专题公告
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