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相关性分析 | R语言 -- 两个变量的相关性分析 -
生信＋实验：最全单基因研究套路总结
随着测序技术的发展，每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长，越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测序数据的意义。已有很多研究表明...
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免疫细胞丰度与基因表达量的相关性热图1.目的 要把免疫细胞与某些基因计算相关性，并画出热图，例如（图） 2.思路 其实就是把完整的相关性矩阵切出一部分，像这样 只拿左上角或者右下角...
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单细胞笔记5-tSNE和UMAP降维 降维顾名思义就是把数据或特征的维数降低，一般分为线性降维和非线性降维，比较典型的如下： 线性降维：PCA(Principal Compon...
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常用分析的R代码——配对样本Wilcoxon符号秩检验（差值不服从正态）前言 专题目的：粗暴，简单，直接套用 如果我们想知道成对测量值（均值）之间是否有差异，可考虑配对t检验。 本章配对样本Wilcoxon符号秩检验...
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R语言初学笔记：差异表达基因
setwd("E:/GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中，分组信息第...
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WGCNA原理和分析流程WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis，即加权基因共表达网络分析。它是一种分析多...
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2022-04-17GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis, 中文翻译就是基因富集分析，最早提出GSEA的文章是下面...
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R语言杂谈（五）---处理数据框
## 如何了解一个数据框 ## 看头 head(exprSet) ##前6行 head(exprSet)[,1:5] ##选取1-5列 ## 看...
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单细胞转录组学习笔记-4-获取Github代码包以及准备工作刘小泽写于19.6.14-15-第二单元第二、三讲：获取Github代码包以及准备工作 笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart...
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