之前摸索生信时,执行一个自己写的小脚本却失败了。后来经上网查找执行了chmod u+x lizi.sh就可以了。这里将学习文件权限的相关内容,就...
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1、切换目录 cd cd destination 绝对文件路径:以正斜线开始的直至目标的全路径,pwd命令可以返回当前所在位置的绝对路径; 相对...
上一节提到根据文本模式进行sed编辑匹配行文本时,往往搭配正则匹配式进行高效检索、编辑。这一次来专门学习下正则表达式的相关知识。 一、基本概念 ...
sed编辑器又称为流编辑器(stream editor),是根据预先提供的一组规则,实现自动格式化、插入、修改或删除文本元素的命令行编辑器。此外...
之前使用生信软件时,会加好多选项参数。这次简单学习下在自己的脚本中,添加选项及参数。最后再学习一个获得用户输入的常用命令read 要点一、命令行...
上次已经学习了基础的结构化命令if语句,循环语句也是使用频率非常高的结构化命令,比如for语句、while语句等。一起来学习吧~ 要点一、for...
之前所说的脚本都是按所有命令顺序依次执行的,但有时我们并非希望如此。所谓结构化命令(structured command)是指对脚本中的命令施加...
在前面的shell命令,环境变量,文本编辑等学习的基础上,可以开始shell脚本的探索之旅了。 要点一、基本脚本知识 shell脚本的关键在于一...
Linux文本编辑器是编辑脚本、文本文件的利器。可供我们进行选择的编辑器也有很多,各有特色,比如vim,nano,emacs,KWrite等。但...
除了基本常用的Linux包(其中大多数已经安装好了),专门的生信软件可以用 conda下载、管理。于是本次简单学习一下Linux如何安装软件程序...
专题公告
生信学习一半以上的操作会用到Linux,因此有必要系统学习一下Linux的相关知识,参考教材为生信大牛推荐的《Linux命令行与shell脚本编程大全》