宏基因组复杂样品基因组的组装（无参考基因组） 什么是Gap以及它是怎样产生的 Gap ： 序列中未确定的区域，通常用N或n表示。 读长限制产生g...
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Meta组装小课题2:GapCloser -
Gapcloser
下载和安装https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/files/GapCloser/ 使用 需要...
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文献笔记五：GapFiller的简单使用文章题目 Toward almost closed genomes with GapFiller 发表期刊及年份 Genome Biology...
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「三代组装」使用Pilon对基因组进行polish
软件安装 官方提供了编译好的jar包，方便使用 如果要顺利运行程序，要求JAVA > 1.7, 以及根据基因组大小而定的内存，一般而言是1M大小...
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SAMtools: SAM格式的处理利器SAM及其相关工具 SAM格式介绍 SAM全称是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比对或联配数据的格式。无论是重...
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简单介绍IGV软件的安装和使用
最近遇到了一个售后，客户在使用IGV时遇到问题，我之前也没有用过此软件。现在便把安装过程记录一下。 IGV（The Integrative Ge...
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2019意犹未尽的基因组可视化IGV（一）刘小泽写于19.6.8之前最开始学习IGV的时候写过两篇推文，当时简单做了了解，但有朋友说意犹未尽，嗯我也这么觉得，总觉得还是学的不够。推荐阅读...
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WGS分析笔记（2）—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前，先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS...
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线粒体组装软件MitoZ安装及运行线粒体组装软件MitoZ安装报错：sqlite3.IntegrityError: UNIQUE constraint failed: synon...
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samtools使用大全
samtools是一个用于操作sam和bam文件（通常是短序列比对工具如bwa,bowtie2,hisat2,tophat2等等产生的，具体格式...
专题公告
二代组装软件，流程等
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