hello，大家好，今天我们要继续分享单细胞空间联合分析的部分，参考文章在High Resolution Single Cell Maps Re...
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单细胞空间联合分析解析 Distinct Cell Organization and Function Across Different Regions of the Human Intestine -
Nat Commun | CODEX——SpatialScore预测皮肤T细胞淋巴瘤对PD-1阻断响应的空间生物标志物皮肤T细胞瘤（CTCL）以其罕见且高死亡率著称，只有1/3的 CTCL 患者从 PD-1 阻断中受益，急需生物标志物来预测抗 PD-1 治疗的临...
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【Cell】CODEX：HCC肿瘤微环境中MAIT细胞的异质性黏膜相关恒定T（MAIT）是人类肝脏中丰富的先天T细胞亚型。MAIT细胞在调节免疫和炎症中起着至关重要的作用，但它们在肝癌中的作用尚不清楚。 美...
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【Nat Commun. 文献分享】snRNA-seq&10x Visium&CODEX联合探索膀胱癌免疫治疗潜在指标手术前的新辅助化疗 (NAC) 和免疫检查点治疗 (ICT) 彻底改变了膀胱癌的管理。如何在临床上找到可以最大获益的患者群，仍然面临缺乏有效临床...
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CPTAC蛋白数据库的使用CPTAC数据库（https://cptac-data-portal.georgetown.edu/datasets[https://cptac...
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单细胞免疫组库数据分析||Seurat整合单细胞转录组与VDJ数据在做10X单细胞免疫组库分析的是往往是做一部分BCR、TCR做一部分5‘转录组，那么怎样才能把两者结合到一起呢？ 今天我们尝试用我们的趁手工具做...
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一个R包玩转单细胞免疫组库分析，还能与Seurat无缝对接
在介绍clonotypr(https://github.com/mattfemia/clonotypr)包之前，我们需要先去解决几个问题： （1...
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使用scRepertoire包进行单细胞免疫组库数据分析简介 scRepertoire包是由华盛顿大学的Nick Borcherding博士开发，是一款针对10X V(D)J数据的免疫组库分析工具。它...
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💉🈯[生信基础|免疫量化]cibersort|timer|xcell等十几种从转录组数据中量化肿瘤浸润性免疫细胞的方法汇总
参考文献:Quantifying tumor-infiltrating immune cells from transcriptomics da...
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复现：纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程，但是发现了几个不一样的地方，所以重新整理流程，代码主要...
专题公告
免疫定量及相关基因分析
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