博文名称：Reduce Dimensions for Single Cell博文链接：https://towardsdatascience.co...

1 Introduction 随着越来越多的scRNA-seq数据集的产生，在它们之间进行比较就显得非常关键。一个核心的应用是比较不同实验室收集...

修改一下上面错误的结论通过如下代码的更细致的观察发现在处理单细胞的数据中，使用SOM方法找到的模式表达基因更倾向于特异性，缺点是会受一些低表达基...

SingleR包简介 SingleR是一个用于对单细胞RNA-seq测序（scRNA-seq）数据进行细胞类型自动注释的R包（Aran et a...

High-throughput sequencing of the transcriptome and chromatin accessibil...

在之前的一个视频学习系列笔记里，有一篇笔记提到了RNA velocity（Single cell RNA-seq data analysis w...

scanpy软件官网：https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html...

这篇文章学习scanpy官网的第二部分，这部分介绍了如何使用scanpy进行轨迹推断。官网地址：https://scanpy-tutorials...

其实这一部分在前面就已经涉及到一些，不过官网既然把这部分拿出来单独作为一大块讲解，可能也是因为这一部分可供选择的可视化方法有很多。对于图片的优化...

2020年3月30-31日，NIH-HCA 2020联席会议通过在线会议形式顺利召开会议目的：通过将实验技术、数据管理和分析领域的重要研究人员召...