这是我听孟浩巍知乎Live：生信进阶第1课-重复Nature文章和B站视频：高通量测序技术交流录像里的笔记哦~ 目录：文章的主要结论解读传统RN...
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解析单细胞RNA-Seq Nature文章 -
10X空间转录组数据分析之空间细胞密度hello，大家好，今天礼拜天，天津雾霾严重，呆在家里学习一下吧。今天给大家分享的是空间转录组的空间细胞密度的分析，这个分析非常重要，下面是一张...
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10X Genomics的空间转录组技术全攻略--空间基因表达实验
本次主要介绍透化、反转录、cDNA合成及文库构建，需要1-1.5天。样本准备以及固定染色之前已经详细介绍过了。 样本冷冻包埋，H&E染色或荧光免...
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10X Genomics的空间转录组全攻略--组织透化优化实验（Tissue Optimization）
组织优化（TO, Tissue Optimization）实验，主要是用于检测样本是否适合进行空间转录实验，以及摸索最佳透化时间。不同的组织类型...
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高质量分析！10x空间转录组新分析思路10x Visium空间转录组已经陪伴我们快2年了。随着时间的推移，我们对空间转录组的认识已经不仅仅是一开始能够知道基因表达的空间位置那么简单，...
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单细胞smart-seq2建库原理应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍，当下应用最火热的是10X Genomics公司的解决方案，但是在某些特殊或者少量细胞样本的单细胞转录组...
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空间转录组测序：助力临床空间分子组学研究
单细胞检测技术的发展为理解组织中细胞的组成与功能提供了手段。但是，现有的方法虽能检测到细胞类型，却无法真实还原在组织中的空间位置。最新的空间转录...
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Seurat 分析Visium空间转录组一、Seurat v3.2 对空间转录组Visium的结果分析中实现的功能： 归一化 降维和聚类 检测空间可变特征(spatially-vari...
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单细胞转录组建库原理：SMART、TargetAmp和10X genomics要实现单细胞mRNA测序，需要解决2个难题：1. 一个人类细胞中，RNA总量大约只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大约只...
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单细胞CNS文章复现Single-cell profiling of tumor heterogeneity and the microenvironment in advanced non-s...今天要复现的这篇文献来自新鲜出炉的NC。 这篇是关于肺癌的。作者通过对42例晚期肺癌进行单细胞测序，描绘了晚期肺癌的单细胞微环境图谱，为肺癌的精...
专题公告
记录一些单细胞测序、空间转录组的文章、技术、处理方法等，稍显杂乱。
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