>library(ggplot2) #载入ggplot2 >data=read.table("GO.count.txt",,header=T,s...
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ggplot2绘制GO注释二级分类统计图 -
用R画GO注释二级分类统计图原文来自生信菜鸟团，又添加了三个配色！ 备注： 参考http://www.biotrainee.com/thread-242-1-1.htmlh...
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测序了，然后呢（四）有了OrgDb才能进行富集分析刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类，OrgDb就是存储不同数据库基因...
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「Bioconductor」再次提醒，研究植物的不要轻易相信你用的注释包有人说Y叔的clusterpofiler的GO注释结果和其他工具不一样，后来询问，发现分析物种是拟南芥。这就让我想起了我之前的一篇文章，「Bio...
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KEGG pathway 注释整理
KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库)，可以获得KE...
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interpro 注释结果简单分析及可视化Interpro数据库 Interpro是集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余蛋白质特征序列数据库， Interpro数据库成员包括Coi...
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InterProscan 输出格式
InterProscan 是一个比较强大的核酸/蛋白序列注释程序。使用命令入下： tsv 输出格式如下： 很好，很强大的功能~
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「生信」基因组功能注释后的基因筛选目录写在前面功能注释数据库介绍方法一: 以KEGG的注释结果为主, 筛选出每个品种包含的特异通路及基因方法二: 利用pfam的注释结果, 过滤掉...
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De novo 基因组GO 注释小窗口关于GO 注释的心得体会 目前对于GO功能注释的思路有 以下常见的四种： 1、BLAST+InterProScan => OmicsBox 可以...
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GO注释结果整理对于非模式生物或者无参考基因组的项目，经常需要进行基因的功能注释，而GO注释是基因功能注释的重要部分。有很多软件能够获得GO注释的信息，例如in...
专题公告
基于egg-mapper以及idmapping的注释
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