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WDL
收录了9篇文章 · 5人关注
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    WDL: 快速编写属于你的分析流程

    前言   一般生物信息分析流程都包含很多的分析步骤,这些步骤之间的联系也有很多情况。例如,流程的步骤中有不少是依赖上一步的结果,同时也有些步骤之...

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    如何用wdl编写生信流程

    作者:童蒙审稿:同尘编辑:amethyst 引言 生信分析离不开各种各样的流程。一个好的流程可以帮我们快速的完成各种各样的分析。然而,如何让我们...

  • WDL学习笔记

    官网是用来学习的最好的地方(然而我也没怎么看...)! WDL是什么? WDL是由Broad Institute开发的一种流程开发语言,全称wo...

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    利用WDL语言书写数据处理流程

    The Workflow Description Language (WDL) is a way to specify data process...

  • WDL-第5学

    问题:用bam2fastx将bam文件转成fastq格式,这里面学到的知识: 学会写parameter_meta,介绍输入输出,它是可以帮忙生成...

  • WDL-第4学

    问题:用flash批量完成数据的拼接,这里面学到的知识点 用struct构建reads的批量输入 可选择参数 解决办法: 来源于bioWDL的一...

  • WDL-第3学

    接下来多个章节都是基于 v1.1语法[https://github.com/openwdl/wdl/blob/main/versions/1.1...

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    WDL-第2学

    本节主要讲述如何配置Cromwell和运行一个简单的hello world的WDL脚本,主要分下面:本节内容来自Five minute to C...

  • WDL-第1讲

    WDL后续一系列学习笔记均来自官方文档[https://cromwell.readthedocs.io/en/stable/CommandLin...