WGCNA 分析确定重要模块之后,如何找模块内的hubgene? 想找hubgene,必须先理解其概念:网络中处于核心位置的点(基因)。在WGC...
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一边学习,一边总结,一边分享! 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码一[https://mp.weixin.qq...
salmon是一款不基于比对而直接对基因进行定量的工具,适用于转录组、宏基因组等分析。其优势是: 定量时考虑到不同样品中基因长度的改变(比如不同...
转录组有参分析之STAR比对及可变剪切 STAR比对的特点: 速度快 准确度高 3'reads soft clip genomeLoad Loa...
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中,可以看出,图片分成2个部分,左边是进化树,右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行...
0.起因 最近在群里看到一个图,棒棒糖图的点用饼图代替了。 然后又看到一个文章里,用饼图代替了富集分析的点图,妙啊~ 这个地球上有什么漂亮的图能...
nohup sh -c '命令行' & nohup sh -c 'for i in *sra; do fasterq-dump --split-...
导读 考虑到在转录组比对时,有许多软件可以使用,但很少有介绍它们之间的差别。因此,本文主要介绍 STAR, KALLISTO, SALMON 之...
前言 对于很多小伙伴来说,刚入手生信时接触最多的就是差异分析,即在基因组层面可以算突变率差异,转录组层面可以算基因表达水平差异,表观组可以观察甲...
环境配置 质检 去接头 比对 得到count值 最终会在目标文件夹下面获得两个文件,counts.txt和counts.txt.summary。...
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