数据科学工厂

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三维基因组：diffHic 差异分析
diffHic diffHic是一款 R 包，几乎包含了 Hi-C 数据分析的全部流程。它从对原始数据（. fastq 格式）进行比对开始，接着...

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三维基因组：Loop结构差异分析(2)
通过聚合峰分析进行可视化既然已经找出了“WT”和“FS”条件之间的差异loop结构，就可以利用聚合峰分析（APA）来直观地展示loop结构调用...

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Scanpy 分析 scRNA-seq：细胞类型注释
引言本系列讲解使用Scanpy分析单细胞（scRNA-seq）数据教程[https://scvelo.readthedocs.io/en/...

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三维基因组：Loop结构差异分析(1)
引言本文展示了如何利用 hictoolsr、DESeq2 和 plotgardener 包来寻找和可视化两种生物条件下差异loop结构的流程。...

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7种比较Linux中文本文件的最佳工具
引言在 Linux 系统管理与开发领域，比较文件是更新配置文件、审查代码更改或排查问题时的一项重要任务。掌握比较两个文本文件并快速找出差异的技...

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CUT&Tag 分析教程 | 完结撒花
引言本系列讲解 CUT&Tag 数据处理和分析教程教程[https://yezhengstat.github.io/CUTTag_tutor...

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Linux: 检测磁盘坏块你得会吧！
引言什么是坏扇区/坏块？它指的是磁盘驱动器或闪存上某个区域无法进行读写操作，通常是由于磁盘表面有永久性物理损伤或者闪存晶体管出现故障。坏扇区...

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单细胞RNA速率分析: scVelo入门教程
引言本系列讲解单细胞（scRNA-seq）中RNA“速率”分析教程[https://scvelo.readthedocs.io/en/st...

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CUT&Tag 数据处理和分析教程（5）
引言本系列[https://yezhengstat.github.io/CUTTag_tutorial/] 将开展全新的CUT&Tag 数据处...

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